UIMP - Cursos de Verano 2020: COVID-19: la epidemiología, la microbiología y la investigación en las estrategias de vigilancia y control de la pandemia
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.12105/25183
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Publication Programa académico. SEMINARIO COVID-19: la epidemiología, la microbiología y la investigación en las estrategias de vigilancia y control de la pandemia. Universidad Internacional Menéndez Pelayo del 27 y 28 agosto de 2020(2020-08-27) Cuenca-Estrella, Manuel; Belda-Iniesta, CristobalLa pandemia por COVID-19 está provocando millones de casos en el todo el mundo, con una mortalidad relevante. El impacto de la infección ha sido devastador y podrían producirse nuevas ondas epidémicas. Para detectar precozmente estas nuevas ondas y controlar eficazmente sus efectos, deben desarrollarse e implementarse sistemas epidemiológicos y biológicos de vigilancia, y que estos sistemas puedan incorporar los hallazgos de las numerosas iniciativas investigadoras que existen por todo el mundo. El seminario va dirigido a profesionales sanitarios en general, con especial orientación a trabajadores de la salud pública: epidemiólogos, microbiólogos, infectólogos y otras especialidades sanitarias directamente implicadas en el control de la pandemia. También debería interesar a investigadores y científicos con proyectos en este campo de conocimiento, sociedades científicas, organizaciones y público en general que puedan estar implicados en los diferentes aspectos de COVID-19.Publication Diagnóstico molecular de COVID-19 Técnicas de referencia, ventajas e inconvenientes(2020-08-27) Casas Flecha, InmaculadaReflexión General. Realización de pruebas de RT-PCR para el diagnóstico de COVID-19. Esquema de trabajo para frenar la transmisión de la enfermedad. Detección de ácidos nucleicos virales. Protocolo PCR tiempo real específico utilizado en el CNM: modificado y adaptado con control interno de amplificación Gen E: screenning Gen N: confirmación Gen RdRp: No se usa por falta de sensibilidad y especificidad Muestras estudiadas para diagnostico CNM. Validación de sistemas comerciales Empresas Españolas: abastecer laboratorios Protocolos propios del CNM. Controles de calidad para los laboratorios El reto del diagnóstico de la infección respiratoria viral en otoño de 2020Publication Técnicas diagnósticas rápidas. Su fiabilidad y papel en la vigilancia(2020-08-27) Tomas- Carmona, Maria del MarTecnicas diagnósticas rápidas de la COVID19. Antigenos y anticuerpos, prubeas rápidas. Inmunocromatografía. RT-PCRS. RT-LAMP. Arrays. CRISP-Cas. Nanotecnología. m.-RT-LAMP-LFB. Espectrometria de masasa.Publication Técnicas serológicas de alto rendimiento. Eficacia en la vigilancia según avanza la pandemia.(2020-08-27) Oteo-Iglesias, JesusIndicaciones de las pruebas serológicas: Diagnóstico. 1. En general desaconsejado. Solo aconsejable para resolver discrepancias entre clínica y resultados de la RT-PCR: • Síntomas muy compatibles con PCR negativa = IgM. ¡Cuidado con la especificidad! Falsos positivos con FR • Manifestaciones tardías en ausencia de diagnostico inicial (meningoencefalitis, gastroenteritis) • Complicaciones: Kawasaki, Guillain-Barré, tromboembolismo. Casos con carga vírica baja en muestras respiratorias. Estudios de seroprevalencia. • Magnitud de la pandemia. ¡Cuidado con especificidad en poblaciones con prevalencias bajas! • Tasa de letalidad. • Evolución y patrones de transmisión. Seguimiento de grandes cohortes. • Identificar factores de riesgo. Apoyo al desarrollo de vacunas. • Selección de candidatos para ensayos clínicos, monitorizando la respuesta. Apoyo al desarrollo de alternativas terapéuticas. • Uso de plasma de convalecientes.Publication Sequence Analysis for Covid-19(2020-08-27) Gut, Ivo• Interaction of the virus and the host is very important • Virus needs to be handled in BSL2 laboratories • Host can present many predisposing low-risk contributing genetic factors – polygenic risk scores • Host can have rare variants that confer high risk – rare disease • Sequencing of the virus and host is possible • Data sharing accelerates discoveries • This can provide insight into the potential outcomes and guide treatment decisionsPublication Otras aproximaciones ómicas. Utilidad en la vigilancia y detección de casos.(2020-08-27) Valencia, AlfonsoEuropean COVID-19 Data. Building the bridges between molecular and medical information. Spanish National Repository for COVID-19. Spanish COVID-19 Registry. Expected data flow across the Spanish system. Spanish COVID-19 Registry: IDs, privacy and provenance. Building the bridges between molecular and medical information. Access to COVID-19 Related Medical Information. Matching variables and codes. Data Model: Tests, treatments, and observations.Publication Sistemas de Vigilancia Epidemiológica de COVID-19. Vigilancia epidemiológica de COVID durante la pandemia. La notificación de casos(2020-08-27) Sierra Moros, María José• Las situaciones epidémicas que evolucionan de forma rápida requieren sistemas que nos permitan la alerta precoz y definiciones sensibles • Rápida evolución en los escenarios de pandemia que llevó a actualizar en numerosas ocasiones la estrategia de vigilancia. • La realidad no era la misma en todas las CCAA. Diferentes escenarios y diferentes capacidades. • Dificultad en las pruebas diagnósticas. Vigilancia basada en casos graves. Cierta distorsión con los test rápidos (periodo corto). • La rápida saturación de los sistemas de vigilancia hizo que se recurriera a información numérica en vez de individualizada. Validación retrospectiva. • La información numérica puede ser útil en momentos de crisis para obtener información a tiempo real, pero puede dar lugar a sesgos • Se ha puesto de manifiesto la dificultad para afrontar una situación como la pandemia de COVID-19 con los sistemas de vigilancia y los recursos de salud pública disponibles. • Necesidad de crear sistemas más flexibles y robustos • Es fundamental que los sistemas de vigilancia en SP estén integrados con los sistemas asistenciales y poblacionales. Automatización de los procesos. (ha habido mucho trabajo manual) • No es un problema tecnológico sino organizativo y de voluntad de las administraciones. Ha habido mucha inversión en innovación y no ha repercutido apenas en la mejora de los sistemas de vigilancia • Es necesario personal suficiente para la vigilancia y el análisis. Consolidar las unidades de vigilancia y crear las alianzas necesarias. • ¿Teníamos los sistemas y la estructura adecuada para la vigilancia de un virus pandémico? ¿Cómo deberíamos trabajar para conseguirlo? • ¿Ha sido útil la vigilancia para la alerta temprana? • ¿La definición de caso ha sido siempre suficientemente sensible? • ¿Hemos sabido definer cual era la información necesaria en cada momento? ¿Ha habido un balance adecuado entre la cantidad- oportunidad-calidad de la información? • ¿La dificultad en la gestión de la información nos ha permitido hacer un análisis oportuno en todos los niveles? • ¿Hasta cuando se podrá mantener el actual sistema de individualizada universal si siguen aumentando los casos?Publication Desarrollo de sistemas de vigilancia centinela de Infección Respiratoria Aguda leve y grave en atención primaria y hospitales en España(2020-08-27) Larrauri, AmparoSistemas de vigilancia de gripe: . Vigilancia centinela en Atención Primaria Vigilancia de gripe en hospitales . Información que proporcionan . Situación ante la pandemia de COVID-19 . Recomendaciones Internacionales . Propuesta de implementación. Experiencias piloto . Consideraciones ECDC/OMS . Ventajas de la vigilancia centinela de IRA/IRAG Retos y perspectivas . ConclusionesPublication Sistema de trazabilidad y rastreo de casos activos. Cómo desarrollarlo y mantenerlo(2020-08-27) Hervada, XurxoDefinición y seguimiento de contactos. Sistemática. Elementos imprescindibles. Sistemas de información, flujo de datos. Rastreo Radar Covid-19.Publication Estudio Nacional de sero-Epidemiología de la Infección por SARS-CoV-2 en España Estudio ENE-COVID(2020-08-27) Pollan-Santamaria, MarinaEstudio ENECOVID. Objetivos del estudio. Diseño. descripción y conclusiones.Publication Otros sistemas de vigilancia e información sobre COVID-19: Resumen y conclusiones(2020-08-27) Castaño, ArgeliaNecesidades/investigación: para mejorar las capacidades y aplicabilidad de la vigilancia microbiológica ambiental en salud pública. •Desarrollo, armonización y validación de métodos de toma de muestra/transporte y conservación /análisis: •captación: métodos mas eficaces que preserven infectividad • métodos rápidos de detección pcr: nanotecnología. •avanzar de enfoques cualitativos a quantitativos: •niveles de infección para poder intercomparar diferentes poblaciones ( aguas) •viabilidad de la infectividad viral en aerosoles: ¿cuál es la dosis infecciosa necesaria para iniciar infección? Coordinación con las autoridades competentes para establecer sistemas de vigilancia estables y representativos.Publication Vigilancia de COVID 19 en aguas residuales(2020-08-27) Domingo-Calap, PilarUtilidad de las aguas residuales como herramienta de vigilancia • Seguimiento temporal • Detección temprana? • Nuevos brotes? • Transmisión comunitaria? • ¿Grandes ciudades? ¿Pueblos? ¿Edificios? • ¿Residencias de ancianos o de estudiantes, colegios, prisiones? ¿Hoteles, cruceros? • Correlación con casos clínicos • Modelización • Predicción • Países no desarrollados • Falta de red de saneamiento • Puesta a punto de metología para futuras pandemiasPublication Detección de SARS-CoV2 en muestras de aire: papel en la vigilancia(2020-08-27) Alcamí, AntonioEvidencias de transmisión aérea de SARS-CoV2 Evidencias epidemiológicas: Gemonas virales en aerosoles han sido detectados - CAPTACIÓN: diversidad de métodos con eficacia variable - DETECCIÓN PCR: cuantificación no es precisa en ocasiones Viabilidad de la infectividad viral en aerosoles - Demostrada en sistema experimental (hasta 3h o 16h) - Una publicación reciente lo demuestra en ámbito hospitalario Método válido para monitorizar presencia/transmisión del virus (hospitales La Paz y Severo Ochoa) Temas a resolver en el futuro: Mejorar sistemas de detección en aire - CAPTACIÓN: métodos mas eficaces que preservan infectividad - MÉTODOS RÁPIDOS DE DETECCIÓN PCR: nanotecnología Utilización de sistemas de detección de virus en aire en: hospitales, transporte, espacios públicos Viabilidad de la infectividad viral en aerosoles ¿Cuál es la dosis de virus necesaria para iniciar infección? Necesario el desarrollo de tecnologías eficientes de inactivación de SARS-CoV2 en el airePublication COVID-19 y su relación con las variables ambientales(2020-08-27) Linares-Gil, Cristina• Los factores ambientales analizados influyen en la transmisión y gravedad de la COVID-19 pero en menor magnitud que las medidas de salud pública. • Var. Meteorológicas: No hay consenso. Temperaturas y humedades altas parecen atenuar la transmisión. • Cont Atmosferica: Los resultados apuntan a que su papel agrava la enfermedad y aumenta la incidencia. Dudas respecto a la hipótesis del transporte aéreo. Análisis Fase 1 Madrid: • Temperaturas y humedades altas se asocian con menor incidencia y gravedad de la enfermedad en el periodo de estudio, siendo especialmente importante el papel de la HA. • Tanto las concentraciones de PM10 como las de NO2 influyen en la incidencia y en la gravedad de la enfermedad, siendo especialmente importante el papel del NO2, en especial en las concentraciones promedio (0 a 14 días) frente a los valores diarios.Publication Financiación extraordinaria de proyectos de investigación sobre el SARS-Cov-2 y la enfermedad Covid-19(2020-08-28) Belda-Iniesta, CristobalDescripción de la financiación de proyectos de investigación sobre el SARS-COV-2 y la enfermedad COVID19, de acuerdo con los principios de necesidad social, emergencia y eficacia dado el interés general, con cargo al FONDO – COVID19 para contribuir a un mejor diagnóstico y tratamiento clínico de pacientes del SNS infectados por SARS-CoV-19 así como a la preparación y respuesta de salud pública en el contexto de la pandemia en curso de SARS-CoV-2Publication Convocatorias internacionales. Análisis del retorno español y oportunidades(2020-08-28) Arevalo-Nieto, Gonzalo• Antecedentes • Plan ERAvsCORONA • Resumen de Convocatorias y Participación Española • Perspectivas a futuro: • Datos • Nuevo Programa HEU con Global Challenge en Salud • Partenariados: One HEALTH-AMR • Algunas ConclusionesPublication Registro ISCIII-COVID-19. La investigación colaborativa en la pandemia(2020-08-28) Diaz Franco, AsuncionRetos • PI ya iniciados • Definición conjunto mínimo de datos: Armonización y estandarización • Interoperabilidad entre sistemas • Cuestiones éticas Conclusiones: • Pandemia de extraordinarias dimensiones y consecuencias sanitarias y no sanitarias • Enfermedad nueva, afectación multisistémica y cuyas secuelas a medio y largo plazo se desconocen • Necesidad de impulsar la investigación cooperativa y multidisciplinarPublication Conclusiones y visión crítica de la sesión “La vigilancia y el diagnóstico microbiológico de COVID-19”(2020-08-28) Oteo-Iglesias, Jesus. Promover la diversificación de las técnicas diagnosticas en busca de rapidez y sencillez para evitar la saturación de capacidades diagnósticas. Cuidado con la posible perdida de sensibilidad/especificidad!! . Diseño de protocolos mixtos (diferentes técnicas combinadas) según escenarios. . Promover la coordinación, entre laboratorios y multidisciplinar, para optimizar esfuerzos. . Secuenciación genómica e inteligencia artificial progresan rápido, papel clave en un futuro próximo pero no inmediato para diagnóstico y vigilancia. . Potenciar las capacidades de gestión e intercambio de la información; no óptimas ni siquiera en las procedimientos más básicos de diagnóstico y vigilancia.Publication Lecciones aprendidas y perspectivas futuras de la vigilancia de COVID-19(2020-08-28) Pollan-Santamaria, MarinaVigilancia para: proporcionar información para tomar decisiones y minimizar el impacto de la pandemia.¿Qué vigilar? Puntos críticos Nuevos indicadores Impacto de la pandemia Letalidad y Mortalidad Estimación de la letalidad de SARS-CoV-2 en España. Otros aspectos: Inteligencia, evaluación, coordinación, Información y formación ciudadana, liderazgo de expertos y participación ciudadana, no es la primera vez..ni será la última